1625. Luis de Sotomayor es nombrado Gobernador. En el Libro 1º de Defunciones, mal conservado, existente en los archivos de la Parroquia del Sagrado Corazón, la primera partida de defunción es la de D. Luís de Sotomayor. En los folios 169 y siguientes de este 1º Libro de Defunciones, figuran los Títulos de Sepulturas, (especie de Registro de la Propiedad de las mismas), Entre las que se encuentran la del Capitán D. Pedro de la Barrera; enterrado en la Nave Mayor de la Iglesia, 2ª hilera, bajo la Capilla Mayor. La de D. Mateo López se encuentra en la Nave de Nuestra Señora del Rosario, junto a la Peana del Altar del Cristo, lindando con las sepulturas de D. Ana López, y la del Capitán D. Andrés Díaz. D. Francisco Monterroso está enterrado en la Nave Mayor, junto al Poste de Santa Lucía. D. Melchor Mariscal, está enterrado, en la Capilla de San Agustín, junto a la Peana del Altar. El Veedor D. Francisco Ruiz está enterrado en la Capilla del Rosario, junto a D. Juan Álvarez de Perea, y el Capitán D. Juan Machado. El Patrón, D Julio Díaz, está enterrado arriba del 2º Poste, a mano derecha. También consta en este Libro que: “…La Cofradía de Nuestra Señora de la Victoria, fundada en la Iglesia de su advocación, extramuros de la Ciudad, tiene obligación de decir todos los sábados una misa cantada, con limosna por cada misa sin procesión ni vísperas…”.
El título de este libro es el siguiente: “Libro que contiene misa de colecturía y otras cosas. A continuación se observa un rótulo, que
dice: “Acaescimentos de los años 1643 y 1644” (sic). Las primeras hojas aparecen muy deterioradas, y recortadas, en forma que parecen haber tenido un índice alfabético de 12 hojas. (José Luís Blasco).
1630. “…La falta actual de documentos y el haber desaparecido los Libros de Defunciones anteriores a 1630 en este Archivo Parroquial…”. ( Fdez. De Castro, 1941).
1630. Jesuitas en Melilla, Cofradía fundada el año 1630. “Contra los Juramentos Blasfemos”.
4.11.1631. Saqueo de la Ermita de Ntra. Sra. de la Victoria en la Alafia. Entraron los moros en la Alafia y saquearon la ermita de la Victoria, tratando de llevarse la Imagen, y al no poder, se llevaron la corona de la Virgen, la del Niño, un crucifijo, alhajas, y le cortaron las manos para llevarse los anillos que fueron rescatados dos días después, por su peso. Así refiere el hecho el Vicario al día siguiente de ocurrir. Estrada, que escribe un siglo después, supone que los moros en número de doce no pudieron levantar la Imagen para llevársela. (G. de Morales).
1631. Vicario: Pedro Navarro y Nogales. Curas: Juan Gómez Romero y Francisco de Villalba, servían Parroquia y Ermita.
14.05.1632. Luis de Sotomayor cae muerto en la Plaza. Pedro Moreo es nombrado interinamente ocupando su puesto. En 1633, Tomás Mejias de Escobedo es nombrado Gobernador.
En 1634. Juan Ruiz Alarcón, Relator del Consejo de Indias, publica en Barcelona, “La Manganilla de Melilla”, y el 8.09.1965 se representa en Melilla en los mismos escenarios que tuvieron lugar los hechos.
El 12.03.1635, Pedro Moreo vuelve a ocupar, como interino, la plaza de Gobernador, relevando a Tomás Mejias de Escobedo. Este Gobernador hizo construir el fuerte de Santo Tomás de la Cantera.
El 4.11.1637, Gabriel de Peñalosa y Estrada es nombrado Gobernador.
El 12.11.1640, el médico-cirujano, Gaspar de Lara, fallece de muerte natural.
El 29.11.1642, el escribano, Luís de Fuentes y Alfaro, muere en su casa de una “apoplejía”.
1641-1663. Libro 5º de Bautismos. 1643-1644. Licenciado Juan Gómez
Romero: “…Acaecimientos de los años 1642-1643”. Libro 1º de Colecturía, folio 26. Sigue al folio 169: "Títulos de Sepulturas antiguas, Tablas de misas que tienen obligación de decir Cofradías del Sacramento y Ánimas”. Libro 1º de Colecturía de la Parroquia de Ntra. Sra. de la Concepción de la Ciudad de Melilla.
El 25.03.1643, muere de tifus, Ana de Montalvo, esposa del Capitán Juan de Machado, “Alcayde Mayor de esta Ciudad”; y cinco días después fallece éste, de la misma enfermedad, que su esposa.
1644. Murió Pedro Mejías, Sacristán de la Iglesia.
23.05.1644. Vicario de la Santa Iglesia, el Licenciado Juan Gómez Romero. Cinco días después lo releva, Juan Bravo de Acuña.
26.09.1644. Breve de Inocencio X, por el que se faculta al Rey de España a nombrar Capellanes Mayores en los Ejércitos.
23.12.1644. Juan Rejón de Silva, en visita de inspección a la Plaza, hace constar en un documento que en la ciudad se refugian muchos moros, y moras, debido a los incidentes que hay entre ellos, mermando las raciones de boca de la población. ¿Les dice esto algo sobre lo que está ocurriendo en la actualidad en la ciudad?. Por ejemplo, en el Hospital Comarcal.
