27.07.1571.- Breve Pontificio para el nombramiento de Vicario Castrense en los Ejércitos: “… Por cuanto que nuestro muy Santo Padre Pío, Papa Quinto, por un Breve dado en Roma a XXVII de julio de este presente de 1571, Nos ha cometido y dado facultad que podamos elegir y nombrar una persona sacerdote de ciencia y conciencia, para que sea Juez Eclesiástico en la Armada y Ejército de Mar y Tierra que anda a cargo y obediencia del Ilmo. Don Juan de Austria, …os habemos nombrado a vos, …y en virtud del dicho Breve, os damos poder y facultad para que ejerzais el dicho oficio de juez eclesiástico…”. Queda nombrado Jerónimo de Manrique.
7.10.1571. Los Capuchinos asisten a la Batalla de Lepanto en calidad de Capellanes Reales.
4.12.1571, Antonio de Tejada es nombrado Gobernador.
1573.- Traza de la Iglesia: “…Siendo necesario que en Melilla se haga una Iglesia por ser pequeña la que antes había, para oir misa la gente que hay en ella…”.
1574. Los rumores de que los turcos pensaban apoderarse de la Laguna (Mar Chica), hace que Felipe II ordene a Vaspasiano de Gonzaga Colonna, Virrey de Navarra, hiciera un reconocimiento de la zona para ver si se puede construir un fuerte para su defensa. El estado del terreno hizo inútil la empresa por ser imposible la entrada, por la bocana arenosa, de barcos en la misma Laguna.
1575.- Juez Eclesiástico Rodrigo de Mendoza sustituye a Jerónimo de Manrique.
15.12.1575. Real Cédula por la que se prorroga por la Real Cédula de 1.08.1562, sobre “…Penas de Cámara, por delitos de cierta gravedad, razón por la cual se aplican para el Fisco Real, en favor de la Iglesia de Melilla por ser pobre y necesitar reparos…”.
1575-1586. Libro 2º de Bautismos. Málaga, 4.12.1978. En esta fecha el archivero no conocía el paradero del Libro 1º de Bautismos. ¿Quién lo tenía? A 1497, 5.02.1576. Han pasado y Melilla no tiene nada que ver con el Obispado de Málaga hasta esta fecha.
1576. Un Breve Pontificio asigna la ciudad de Melilla al Obispado de Málaga.
El 25.03.1579, se publica un Real Decreto concediendo ayudas suplementarias para reparar el templo. Esto fue debido a que meses antes se dejó sentir un terremoto en Melilla que destruyó varias casas y la Iglesia, y lo que actualmente es la Bocana de la Mar Chica se abrió más hacia elmar, dejando pasar agua hasta confundirse con el mar abierto.
1595. Real Cédula en la que se refiere a que las mujeres que comerciaban con sus cuerpos, con los componentes de la guarnición, eran las únicas que tenían permiso para tener encendida la luz hasta la madrugada. Pero no permitía los amancebamientos: “(…) Estas mujeres deben tener el candil encendido hasta dos horas de la noche, sin estar amancebados porque en caso contrario el Alcayde los castigará con rigor”.
Este mismo año es nombrado Gobernador, Jerónimo de los Barrios. Al año siguiente, 1596, lo sustituye, Martín Dávalos Padilla.
Agosto 1603. Fallece en Madrid Pedro Benegas. Pedro de Heredia construye el Torreón de la Avanzadilla y otro cerca de la Puerta de Tierra, para fortalecer sus baterías.
1603-1604. Vicario, Fray Rodrigo López Melero. “…La Iglesia tenía arrendado un horno de pan, huerta y censos…”. En 1604, la Ermita, (la segunda), de Ntra. Sra. de la Victoria. Saliendo del Puente Levadizo de la Puerta de Santiago; bajo ella, espacio para enterramientos. Pedro de Heredia solicita 6.000 ducados para obras en Melilla y remite al Rey dos trazas, (planos) de la Ciudad.
El primer polvorín que hubo en Melilla, es el que figura en el plano de ese mismo año, con el nombre: “Torre de la Polvora”, cercano al antiguo Hospital del Rey, lugar donde un siglo más tarde se abrió el Túnel de la Florentina.
El 25.06.1604, el Fraile Trinitario del Convento de la Trinidad de Málaga, es enviado por el Obispo a predicar la Cuaresma. El 28.06.1604, marchó de Melilla el Fraile Trinitario portugués, con 23 años residiendo en Melilla, (1581-1604), acusado de no confesarse durante todo este tiempo.
En 1606, Alonso de Vargas es nombrado Gobernador, cesando al año siguiente.
29.01.1606. Real Cédula al Gobernador Pedro de Heredia, dispensando de guardias y velas al sacristán Pedro Mexía, por ser casado con cuatro hijos, y tener sólo dos escudos y medio de sueldo mensuales. (G. de Morales). 1610, ¿Nueva Iglesia Parroquial? (A. Bravo/ Sergio).
1612, Domingo Dieguez es nombrado Gobernador.
21.10.1613. Tiene lugar un terremoto, en lo que se instituye desde ése día una procesión en conmemoración de Santa Ursula.
En 1615, se hacen nuevas gestiones para el cargo de Capellán Mayor de la Armada, a favor de Fray Martín de Vivanco, sin resultado positivo.
Tampoco se concedió el citado título a Fray Diego Calasoriano, que acompañaba al Duque de Medina Sidonia, como Capellán Principal.
En 1617, Gaspar de Mondragón es nombrado Gobernador.
1618-1640. Libro 4º de Bautismo. En 1618, Domingo de Ochoa es nombrado Gobernador. En 1619, Diego de Leyva es nombrado Gobernador. En 1620, Francisco Rodríguez Sanabria es nombrado Gobernador. 1622. Francisco Ruiz es nombrado Gobernador. El 6.09.1622. Bula Pontificia del Papa Gregorio XV: “…Agregamos y incorporamos (sic) los fuertes de Melilla y el Peñón de Vélez de la Gomera, al Obispo de Málaga…”.
1624. Francisco de Córdoba y Rojas, Conde de Casa Palma, es nombrado Gobernador interino.
