A la misma hora que la Ciudad Autónoma, la Delegación del Gobierno organizó otro minuto de silencio. En la sede de la institución del Ejecutivo Central, autoridades civiles y militares, representantes de diferentes entidades sociales y organizaciones y un nutrido grupo de ciudadanos se dieron cita para guardar un minuto de silencio por las víctimas de la DANA.
Tras el minuto de silencio, la delegada del Gobierno, Sabrina Moh, ha agradecido a los congregados su asistencia para trasladar toda la solidaridad y afecto de Melilla a las familias de las personas que han fallecido y ha señalado que Melilla y España entera lloran por esta tragedia. También ha tenido palabras de reconocimiento y agradecimiento para todas las personas, cuerpos y organismos que se han volcado y lo siguen haciendo para ayudar a los afectados.
Al igual que todos los edificios oficiales, las banderas en la Delegación también ondean a media asta.